뉴욕에서 연이어 마법 테러를 일으키는 바벨 여단에 맞서 마법 소녀들이 출격한다. 음악을 무기로 다루는 마술 용병 샤오와 골렘 마스터 두 사람에 맞서는 자드. 네크로맨서 발바라와 대치하는 소연과 클레어. 아스카, 쿠루미, 미아 세 사람도 개량된 마법 생물 병기 즈메이와의 전투에 임한다. 그때, 납치된 사야코에게 이상이 일어나는데――!? 그리고 드러나는 바벨 여단의 진정한 목적! 전설의 다섯 사람(매지컬 파이브)과 제2세대 마법 소녀들이 전례 없는 긴급 사태에 협력하는 제12권!!