오키나와에서의 격투는 마침내 종결을 맞이하고, 비합법의 마법소녀인 치사토는 포로가 된다. 그러나 한편으로, 타비라 장군이 가져온 마법소녀용의 새로운 장비는 적의 손에 넘어가고 말았다... 우크라이나 동부의 분쟁에서 불안한 움직임을 감지한 이이즈카 일행은 그곳에 개입하기로 결정한다. 아스카와 그녀의 'M반'은 다음 임무로 우크라이나로 향하게 되지만, 그곳에도 러시아 군과 비밀리에 접촉하고 있던 바벨 여단의 그림자가 드리워져 있다... 번외편 '비밀 기지의 비밀!'도 수록된, 새로운 장으로의 돌입을 알리는 제6권!