세계를 파괴하려는 여단장의 정체는 한때의 동료 프란시느였다! 프란시느는 마법 아이템과 명수왕(디스비스트)의 마력을 사용하여 사야코를 최강의 마법 소녀, 섹메트로 변화시킨다! 제2세대 마법 소녀, 'M반'의 치사토, 나르지니, 그리고 '전설의 다섯(매지컬 파이브)'가 세계의 운명을 걸고 마지막 전투에 나선다!! 한때 전란을 진정시킨 마법 소녀들의 그 후의 이야기, 당당히 완결――!!