물리학을 공부하는 대학원생, 오리카사 시즈네는 보통은 있을 수 없는 초신성과 같은 뉴트리노 데이터의 발생을 목격하게 된다. 그리고 다음 순간, 눈앞에 거의 나체인 아름답고 어린 소녀가 나타났다. 그녀는 아리아라고 자신을 소개하며, 다른 세계에서 새로운 주인을 찾기 위해 온 기계 노예라고 말한다. 그녀의 주인이 되는 것을 선택한 시즈네였지만, 이 세계에는 다른 기계 노예와 그것을 가진 자들이 존재하고 있었다――.