이제 곧 중학교 2학년이 되는 아사히나 미라이는 봄방학이 있는 밤, 하늘에서 의문의 물체가 근처 공원으로 떨어지는 것을 발견합니다. 「혹시 마법사일지도!」라는 기대에 부풀어 있는 미라이는, 다음날 아침, 두근두근거리며, 어려서부터 쭉 귀여워하고 있는 곰인형 「모후룬」과 함께 공원으로 향합니다. 그러자 거기서 본 것은...빗자루에 걸터앉아 공중으로 떠있는 여자아이...! 리코라고하는 그 여자아이는, 무려 마법사!! 미라이는, 마법사에 흥미진진한 리코에게 질문을 퍼붇는다. 리코는 "어떤 물건"을 찾으러 미라이가 사는 세계에 온것 같습니다. 게다가 자세히 보면 두 사람은 같은 펜던트를 쓰고 있고... 그런 가운데 어둠의 마법사 도쿠로쿠시의 하인 배티가 두 사람 앞에 나타납니다! 「링클스톤 에메랄드」를 빼앗으려고 리코에게 다가오는데, 아무래도 리코도 「링클스톤 에메랄드」를 찾는 것 같아서... 배티의 어둠의 마법으로 태어난 괴물 요쿠바루에게 몰렸던 그때... 미라이와 리코, 그리고 모후룬이 손을 잡고, 마법의 주문 「큐어 업 라파파!」라고 외치자 펜던트가 빛납니다. 그리고 전설의 마법사 프리큐어가 탄생합니다...!!!