桜が散り始めた春の日。天真爛漫な小国のお姫様・リオンはホッカイドウの学校に通うことに。そこは世界の平和を守る定理者〈ルビ：ロジカリスト〉を育成するため、ALCAが運営する特別な教育機関。リオンが入った1年Sクラスには、定理者〈ルビ：ロジカリスト〉のニーナをはじめ、個性的なクラスメイトたちがたくさん。定理者〈ルビ：ロジカリスト〉のヒナたちが送る、とってもにぎやかでかわいらしい日々--合体〈ルビ：トランス〉!!　はじめます